La última década ha traído cambios en lo que podemos definir como el Gold Standard para la secuenciación de ADN/ARN. Con más de una década de experiencia en Next Generation Sequencing, STAB VIDA ofrece el mejor valor posible en cuanto a la tecnología NGS. Tenemos la capacidad de llevar a cabo su proyecto de secuenciación con el más alto nivel de confianza y siempre ofreciendo un soporte personalizado al cliente.
Experimente nuestras estrategias para secuenciar Genomas, Exomas, Transcriptomas, Metagenomas, etc. Al recurrir a la secuenciación masiva, disfrute de la posibilidad de producir millones de lecturas de secuenciación, con o sin análisis bioinformático que responda a todas sus preguntas por un precio justo.
En STAB VIDA ofrecemos servicios de NGS, utilizando diferentes plataformas: Ion TorrentTM ,Illumina® HiSeq®2500 o MiSeq®, para proporcionar un servicio adecuado a sus necesidades. Además, ofrecemos la posibilidad de realizar análisis bioinformáticos de sus resultados de secuenciación.
Si necesita ayuda en la elaboración de su proyecto, contáctenos por correo electrónico (sales@stabvida.com) y nuestro equipo de expertos le ayudará a definir la mejor estrategia para obtener los resultados que desea para su proyecto, ajustando el precio a sus necesidades. Por otro lado, si ya tiene su proyecto bien definido y lo que desea es un presupuesto oficial, inicie sesión en nuestro sitio web y solicite un presupuesto en la sección de NGS, eligiendo la opción de servicio que desee.
Obtendrá millones de secuencias para cada una de sus muestras dentro de unos pocos días.
METAGENÓMICA/METABARCODING
La secuenciación de amplicones del ARN ribosomal 16S/ITS es un método bien establecido que se utiliza para identificar y comparar bacterias y hongos. Este es un método excelente para la comparación de la filogenia y taxonomía de microbiomas o entornos complejos. Se pueden utilizar objetivos adicionales como 18S, CO1, etc. para caracterizar otras especies.
Nuestro protocolo estándar 16S amplifica la región variable V3-V4 utilizando los primers:
• 341F - CCTACGGGNGGCWGCAG
• 785R - GACTACHVGGGTATCTAATCC
Nuestro protocolo estándar ITS amplifica la región variable ITS1 utilizando los primers:
• ITS1f - CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA
• ITS2 - GCTGCGTTCTTCATCGATGC
Ya sea con nuestros objetivos estándar o personalizados, podemos ayudarle a obtener la máxima información posible de sus muestras a través de nuestro servicio de análisis bioinformático basado en QIIME2.
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SECUENCIACIÓN DE ARN
La secuenciación de ARN (ARN-seq) permite la detección e identificación de moléculas transcritas. Analice transcriptomas completos para estudiar patrones específicos de expresión génica o descubrir marcadores. El ARN-seq no requiere conocimiento previo de secuencias genéticas. Obtenga una cobertura completa del transcriptoma y descubra información sobre la estructura y eventos alternativos de splicing.
mRNA-Seq
La biblioteca mRNA-Seq se basa en el enriquecimiento de mRNA Poli-A. El enriquecimiento poli-A proporciona una opción altamente sensible para la detección de transcritos en muestras sin degradación.
Transcriptoma completo
La biblioteca de transcriptoma completo se basa en la depleción de ARN ribosomal, enriqueciendo la muestra tanto en mRNA como en ARN no codificantes. Esta estrategia de depleción de rRNA es ideal para muestras que presentan un grado moderado de degradación.
Small RNA
Los métodos de preparación basados en el enriquecimiento de Poli-A y el transcriptoma completo no permiten una evaluación adecuada de Small RNAs, que requieren un protocolo de preparación de muestras específico, seguido de una selección de tamaño adecuada. De esta manera, podemos ofrecer un servicio completo de descubrimiento y perfilado de Small RNAs.
Los datos de ARN-seq pueden servir a múltiples propósitos, siendo nuestro servicio estándar de análisis bioinformático adecuado para caracterizar la expresión génica y la expresión diferencial de genes.
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SECUENCIACIÓN DE GENOMAS COMPLETOS
Especie Única/Muestra Pura
La Secuenciación del Genoma Completo (WGS) es un método integral para analizar genomas completos, capaz de permitir un análisis exhaustivo de la estructura y variantes presentes en el genoma. Los datos de WGS pueden ser adecuados para diferentes enfoques: ensamblaje de novo, anotación o mapeo con referencia y detección de variantes, según el objetivo del estudio.
Metagenómica de Genoma Completo (WGM)
La Metagenómica de Genoma Completo (WGM), o Secuenciación Metagenómica de Disparo, es un enfoque de secuenciación poderoso que proporciona una visión de toda la biodiversidad y funciones de los organismos presentes en una muestra. En última instancia, la WGM busca la secuenciación de todos los genomas presentes en las muestras.
Manejar toda la información generada puede ser un desafío, por lo que también puede aprovechar nuestro servicio de análisis bioinformático para ayudarlo a aprovechar al máximo sus datos.
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Secuenciación de Exomas Completos
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La Secuenciación de Exoma Completo (WES) tiene como objetivo secuenciar específicamente las regiones exónicas del genoma. Aunque constituyen aproximadamente solo el 1% del genoma humano, la mayoría de las variantes relacionadas con enfermedades ocurren dentro de las regiones codificantes del genoma. Con WES, podemos detectar variantes con alta confianza y explorar su significado, ya sea mediante la comparación con bases de datos apropiadas o mediante análisis predictivos.
Para ello, puede utilizar nuestro servicio de bioinformática, que abarca desde el mapeo con referencia hasta la detección y anotación de variantes con diversas bases de datos.
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Proyectos personalizados
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Run Only
Nuestro servicio Run Only está diseñado para clientes que prefieren preparar sus propias bibliotecas y tener un mayor control sobre todo el proceso, o que desean preparar bibliotecas utilizando flujos de trabajo personalizados.
Epigenética
La metilación del ADN es un importante mecanismo epigenético capaz de influir en la expresión génica y la estructura de la cromatina. El estudio de estos mecanismos es particularmente relevante, ya que la desregulación de la metilación está estrechamente asociada con múltiples enfermedades. Para permitir este estudio, STABVIDA ofrece servicios de:
• Whole Genome Enzymatic Methylation Sequencing (WGEMS) – Permite detectar patrones de metilación de citosina en todo el genoma, incluyendo CpG, CHH y CHG.
• Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS) - Consiste en secuenciar solo regiones del genoma ricas en CpG, mediante la digestión con enzimas de restricción.
La secuenciación de cromatina inmunoprecipitada (ChIP-seq) es un método que permite analizar interacciones entre proteínas y ADN. Con nuestro servicio de ChIP-seq, podrá detectar de manera eficiente y precisa los sitios de unión de proteínas de interés, especialmente factores de transcripción y otras proteínas asociadas a la cromatina.
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SECUENCIACIÓN DE PLÁSMIDOS Y ADN MITOCONDRIAL
Obtenga la secuencia de su plásmidos y de sus ADN mitocondriales en 72h con 100x o 200x cobertura.
Los plásmidos son herramientas esenciales utilizados en la ingeniería genética,para la transformación genética y la manipulación genética de células procariotas y eucariotas. Son muy valiosa cuando se trata de la síntesis de proteínas de interés en grandes cantidades (por ejemplo, insulina o antibióticos).
La secuenciación de ADN mitocondrial es una herramienta útil para el estudio de ciertos tipos de cáncer, el envejecimiento, la genética de poblaciones y evaluación de la biodiversidad. Utilice nuestro servicio también para descubrir las mutaciones heteroplásmicas de sus muestras.
Usando Ion TorrentTM y un software específico, obtendrá datos de forma meticulosa y de alta calidad. Los datos en brutos que se obtienen constan de hasta 1 millón de lecturas de 200 pb con una gran cobertura para cada una se sus muestras.
Contacte con nosotros: sales@stabvida.com / tel: +351 210438606 / skype ID: Sales from STAB
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