Pipelines Metabarcoding • 16s • 18s • its

Transforma Raw Data em informação útil em minutos

Bioinformática Self-Service para investigadores do microbioma. Carrega os teus ficheiros FASTQ, escolhe a tua pipeline e explora relatórios interativos — sem necessidade de linha de comandos.

Sem Necessidade de Cartão de Crédito Resultados em Horas Segurança de Nível Empresarial
Porque Silicobiome

Tudo o que precisas para Análise de Amplicões

Desde a raw data de sequenciação até aos dados prontos para publicação

FASTQ

Drag-and-Drop Upload

Drag-and-Drop ficheiros FASTQ diretamente no browser. Arquivos paired-end, multiplexados e comprimidos com gzip — todos processados automaticamente.

CONFIG

Pipelines Customizadas

Personaliza a tua pipeline de bioinformática, especificando os teus marcadores de amplicão, adaptadores e primers. Todos os parâmetros a jusante são otimizados automaticamente para o ensaio que escolheste.

VIZ

Reports de Qualidade

Obtém resultados completos compatíveis com o QIIME 2: diversidade alfa/beta, gráficos PCoA, gráficos taxonómicos, árvores filogenéticas, tabelas de características e relatórios de controlo de qualidade.

GDPR

Segurança Empresarial

Infraestrutura on-prem dedicada. Encriptação AES-256. Em conformidade com o RGPD. Políticas de eliminação automática. Os teus dados nunca saem do nosso ambiente seguro.

DB

SILVA / UNITE

Atribuição taxonómica completa, utilizando as bases de dados de referência mais recentes para bactérias, eucariotas e fungos, em todos os tipos de amplicões.

FAST

Resultados em < 2 horas

Graças à nossa infraestrutura dedicada, a maioria dos conjuntos de dados é processada em menos de 2 horas.

Como funciona

Dos Raw Reads aos Resultados em 5 passos

1
FASTQ • FQ.GZ

Importa os teus dados

Arrasta e solta ficheiros FASTQ. Nós tratamos do resto.

2
16S • 18S • ITS

Configura a Pipeline

Escolhe 16S, 18S ou ITS. Define adaptadores e trimmers, nós otimizamos o resto.

3
< 2 Horas

Executa a Pipeline

A nossa infraestrutura dedicada escala automaticamente para processar o teu conjunto de dados em menos de 2 horas.

4
FLEXÍVEL

Paga por Execução

Sem necessidade de subscrição. Paga apenas pelas análises que executares. Também disponíveis planos empresariais de tarifa fixa.

5
INTERATIVO

Explora os Resultados

Gráficos de diversidade interativos, gráficos de taxonomia, ordenações PCoA e curvas de rarefação — tudo transferível e partilhável.

Experimenta agora

Executa a Tua Primeira Pipeline Sem Necessidade de Registo

Carrega os teus FASTQs, escolhe os teus marcadores e vê o Silicobiome a gerar os resultados de diversidade.

Sem Necessidade de Conta
Paga Apenas Quando Houver Resultados
Cálculo de Preço Instantâneo
Vê os Resultados Imediatamente
Pipelines de Análise

Concebido à Medida para Cada Tipo de Amplicão

Escolhe entre pipelines validadas para sequenciação de amplicões 16S, 18S e ITS. Cada uma é otimizada para o seu gene marcador e base de dados de referência.

Bactérias e Arqueias

Pipeline 16S rRNA

O padrão de ouro para o perfil de comunidades bacterianas. A nossa pipeline suporta V3-V4, com pares de primers personalizados, inferência de ASV baseada em DADA2 e taxonomia SILVA.

Bases de Dados de Referência
SILVA
Duração Típica
~1 hora (10 amostras)
Passos da Pipeline
  1. 01Controlo de Qualidade (FastQC + MultiQC)
  2. 02Corte de Primers (Cutadapt)
  3. 03Junção de leituras emparelhadas (VSearch)
  4. 04Estimativa de Parâmetros (Figaro)
  5. 05Filtragem e Remoção de Ruído (DADA2)
  6. 06Classificação Taxonómica (SILVA e NCBI)
  7. 07Alinhamento e Filogenia
  8. 08Análise de Diversidade
Preços

Escala com a Tua Investigação

Sem custos escondidos. Paga por amostra, ou escolhe um plano de subscrição para custos por análise mais baixos e prioridade no processamento.

Pagamento por Utilização Recomendado

Configura apenas o que precisas e aprova o orçamento antes de começares.

A partir de €5 / amostra

Preço calculado na configuração

Os custos dependem do tipo de pipeline, número de amostras, bases de dados de referência e classificadores personalizados. Vês o orçamento completo antes de iniciares a análise.

Configura e Obtém o Preço
O preço depende de
Tipo de pipeline16S - 18S - ITS
Número de amostras1 - ilimitado
Base de dados de referênciaSILVA - UNITE
Profundidade da análiseDiversidade - Taxonomia - Personalizado
O orçamento exato é apresentado antes da pipeline começar. Só pagas na conclusão.
Ou escolhe um plano de subscrição - ideal para equipas com volume de análises recorrente
Laboratório

Para laboratórios em crescimento com elevado rendimento e fluxos de trabalho repetíveis.

€499 / mês
Contactar Vendas
  • 275 amostras por mês
  • Pipelines 16S, 18S e ITS
  • Sem custos adicionais para classificadores personalizados
  • Prioridade na fila de processamento
  • Exportações prontas para publicação
  • Suporte por email e On-Call
Instituição

Para instalações centrais e ambientes multi-equipa com necessidades avançadas de conformidade.

Personalizado
Contactar Vendas
  • Amostras ilimitadas
  • Pipelines 16S, 18S e ITS
  • Sem custos adicionais para classificadores personalizados
  • Ainda mais prioridade na fila de processamento
  • Exportações prontas para publicação
  • Suporte por email e On-Call
  • Engenheiro de suporte dedicado
Planos de Subscrição - Disponíveis a partir de 15 de setembro

Perguntas Frequentes

Respostas rápidas sobre propriedade dos dados, tempo de entrega, formatos suportados e opções de implementação antes de iniciares a tua análise.

Fala Connosco
A quem pertencem os dados que carrego?
Mantens a propriedade total de todos os dados de sequenciação, metadados e resultados gerados que carregares. O Silicobiome processa os ficheiros apenas para executar as análises selecionadas.
Quão rápido terei os meus resultados?
A maioria das execuções padrão de 16S, 18S e ITS são concluídas em menos de 2 horas, dependendo o tempo do número de amostras, complexidade da pipeline e disponibilidade da nossa infraestrutura.
Que formatos de entrada são suportados?
O Silicobiome suporta ficheiros FASTQ, FQ e arquivos FASTQ comprimidos com gzip para as amostras. .qza é suportado para classificadores personalizados.
Posso personalizar os parâmetros da análise?
Sim. Podes configurar adaptadores, primers e classificadores personalizados antes de iniciar uma execução. As opções de análise seguintes são otimizadas para o ensaio escolhido.
O que acontece se uma pipeline falhar?
Se uma pipeline falhar ao processar os teus dados, poderás reconfigurar a execução ou contar com a nossa equipa de suporte para a processar novamente. Sem custo quando a pipeline falha, só pagas quando os resultados estiverem disponíveis.
Posso implementar o Silicobiome on-premise?
Não. O Silicobiome é uma tecnologia proprietária criada pela STABVIDA e está disponível apenas como serviço.

Pronto para Acelerar a Tua Investigação do Microbioma?

Junta-te a centenas de investigadores que usam o Silicobiome para transformar dados brutos de sequenciação em informação útil.

Sem necessidade de cartão de crédito Sem necessidade de conta Paga apenas quando os resultados estiverem disponíveis