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Importez vos données
Glissez-déposez vos fichiers FASTQ. Nous nous occupons du reste.
Bio-informatique en libre-service pour les chercheurs en microbiome. Téléversez vos fichiers FASTQ, choisissez votre pipeline et explorez des rapports interactifs — sans ligne de commande.
Des données de séquençage brutes aux figures prêtes pour publication
Déposez vos fichiers FASTQ directement dans le navigateur. Paired-end, multiplexés et archives compressées gzip — tout est géré automatiquement.
Personnalisez votre pipeline bio-informatique en spécifiant vos marqueurs d'amplicons, adaptateurs et amorces. Tous les paramètres en aval sont optimisés automatiquement pour le test choisi.
Obtenez des résultats compatibles QIIME 2 : diversité alpha/bêta, graphiques PCoA, diagrammes taxonomiques, arbres phylogénétiques, tableaux de caractéristiques et rapports de contrôle qualité.
Infrastructure dédiée sur site. Chiffrement AES-256. Conforme au RGPD. Politiques de suppression automatique. Vos données ne quittent jamais notre environnement sécurisé.
Attribution taxonomique complète à l'aide des bases de données de référence les plus récentes pour les bactéries, eucaryotes et champignons, pour tous les types d'amplicons.
Grâce à notre propre infrastructure dédiée et évolutive, la plupart des jeux de données standards sont entièrement traités en moins de 2 heures.
Glissez-déposez vos fichiers FASTQ. Nous nous occupons du reste.
Choisissez 16S, 18S ou ITS. Définissez adaptateurs et trimmers, nous optimisons le reste.
Notre infrastructure dédiée s'adapte automatiquement pour traiter votre jeu de données en moins de 2 heures.
Aucun abonnement nécessaire. Payez uniquement les analyses que vous lancez. Des forfaits entreprise à tarif fixe sont également disponibles.
Graphiques de diversité interactifs, diagrammes taxonomiques, ordinations PCoA et courbes de raréfaction — tous téléchargeables et partageables.
Téléversez vos FASTQ, choisissez vos marqueurs et regardez Silicobiome générer les résultats de diversité.
Choisissez parmi des pipelines validés pour le séquençage d'amplicons 16S, 18S et ITS. Chacun est optimisé pour son gène marqueur et sa base de données de référence.
La référence pour le profilage des communautés bactériennes. Notre pipeline prend en charge V3-V4, avec des paires d'amorces personnalisées, une inférence ASV basée sur DADA2 et une taxonomie SILVA.
Conçu pour un profilage eucaryote large sur des échantillons environnementaux et associés à un hôte. Optimisé pour les protistes, microeucaryotes et communautés mixtes avec une taxonomie basée sur PR2.
Conçu pour l'analyse des communautés fongiques à l'aide des marqueurs ITS1 ou ITS2. Pensé pour une discrimination au niveau de l'espèce lorsque possible, avec la taxonomie UNITE et des synthèses axées sur le mycobiome.
Aucun frais caché. Payez à l'échantillon, ou choisissez un forfait d'abonnement pour un coût par analyse réduit et une priorité de traitement.
Configurez uniquement ce dont vous avez besoin et validez le devis avant que quoi que ce soit ne démarre.
Les coûts dépendent du type de pipeline, du nombre d'échantillons, des bases de données de référence et des classificateurs personnalisés. Vous voyez le devis complet avant de lancer l'analyse.
Configurer et obtenir le prixPour les chercheurs individuels et petits laboratoires avec des projets mensuels.
Pour les laboratoires en croissance avec des besoins de débit élevé et des flux de travail répétables.
Pour les plateformes centrales et environnements multi-équipes avec des besoins de conformité avancés.
Réponses rapides sur la propriété des données, les délais, les formats pris en charge et les options de déploiement avant de démarrer votre analyse.
Parlez-nousRejoignez des centaines de chercheurs qui utilisent Silicobiome pour transformer des données de séquençage brutes en informations exploitables.