Pipelines Metabarcoding • 16s • 18s • its

Verwandeln Sie Rohdaten in verwertbare Erkenntnisse in wenigen Minuten

Selbstbedienungs-Bioinformatik für Mikrobiomforscher. Laden Sie Ihre FASTQ-Dateien hoch, wählen Sie Ihre Pipeline und erkunden Sie interaktive Berichte — ohne Kommandozeile.

Keine Kreditkarte erforderlich Ergebnisse in Stunden Sicherheit auf Unternehmensniveau
Warum Silicobiome

Alles, was Sie brauchen für die Amplikon-Analyse

Von rohen Sequenzierungsdaten bis zu publikationsreifen Abbildungen

FASTQ

Drag-and-Drop-Upload

Ziehen Sie FASTQ-Dateien direkt in den Browser. Paired-End, multiplexte und gzip-komprimierte Archive — alles wird automatisch verarbeitet.

CONFIG

Individuelle Pipelines

Passen Sie Ihre Bioinformatik-Pipeline an, indem Sie Ihre Amplikon-Marker, Adapter und Primer angeben. Alle nachgelagerten Parameter werden automatisch für Ihren gewählten Assay optimiert.

VIZ

Qualitätsberichte

Erhalten Sie vollständig QIIME-2-kompatible Ergebnisse: Alpha-/Beta-Diversität, PCoA-Plots, Taxonomie-Balkendiagramme, phylogenetische Bäume, Feature-Tabellen und QC-Berichte.

GDPR

Unternehmenssicherheit

Dedizierte On-Premise-Infrastruktur. AES-256-Verschlüsselung. DSGVO-konform. Automatische Löschrichtlinien. Ihre Daten verlassen nie unsere sichere Umgebung.

DB

SILVA / UNITE

Vollständige taxonomische Zuordnung mit den neuesten Referenzdatenbanken für Bakterien, Eukaryoten und Pilze, für alle Amplikontypen.

FAST

Ergebnisse in unter 2 Stunden

Dank unserer eigenen skalierbaren Infrastruktur werden die meisten Standard-Datensätze in unter 2 Stunden vollständig verarbeitet.

So funktioniert's

Von Rohdaten zu Ergebnissen in 5 Schritten

1
FASTQ • FQ.GZ

Daten importieren

FASTQ-Dateien per Drag-and-Drop hochladen. Wir übernehmen den Rest.

2
16S • 18S • ITS

Pipeline konfigurieren

Wählen Sie 16S, 18S oder ITS. Adapter und Trimmer festlegen, wir optimieren den Rest.

3
< 2 Stunden

Pipeline ausführen

Unsere dedizierte Infrastruktur skaliert automatisch, um Ihren Datensatz in unter 2 Stunden zu verarbeiten.

4
FLEXIBEL

Pro Durchlauf zahlen

Kein Abonnement nötig. Zahlen Sie nur für die Analysen, die Sie ausführen. Unternehmens-Flatrate-Pläne ebenfalls verfügbar.

5
INTERAKTIV

Ergebnisse erkunden

Interaktive Diversitätsdiagramme, Taxa-Balkendiagramme, PCoA-Ordinationen und Rarefaction-Kurven — alle herunterladbar und teilbar.

Jetzt ausprobieren

Führen Sie Ihre erste Pipeline aus Ohne Registrierung

Laden Sie Ihre FASTQs hoch, wählen Sie Ihre Marker und sehen Sie, wie Silicobiome Diversitätsergebnisse liefert.

Kein Konto erforderlich
Zahlung erst bei verfügbaren Ergebnissen
Sofortige Preisberechnung
Output-Metriken sofort einsehen
Analyse-Pipelines

Maßgeschneidert für jeden Amplikontyp

Wählen Sie aus validierten Pipelines für 16S-, 18S- und ITS-Amplikonsequenzierung. Jede ist für ihr Ziel-Markergen und ihre Referenzdatenbank optimiert.

Bakterien & Archaeen

16S-rRNA-Pipeline

Der Goldstandard für die Profilierung bakterieller Gemeinschaften. Unsere Pipeline unterstützt V3-V4, mit individuellen Primerpaaren, DADA2-basierter ASV-Inferenz und SILVA-Taxonomie.

Referenzdatenbanken
SILVA
Typische Bearbeitungszeit
~1 Stunde (10 Proben)
Pipeline-Schritte
  1. 01Qualitätskontrolle (FastQC + MultiQC)
  2. 02Primer-Trimming (Cutadapt)
  3. 03Zusammenführen gepaarter Reads (VSearch)
  4. 04Parameterschätzung (Figaro)
  5. 05Filterung und Denoising (DADA2)
  6. 06Taxonomische Klassifikation (SILVA & NCBI)
  7. 07Alignment und Phylogenie
  8. 08Diversitätsanalyse
Preise

Skalieren Sie mit Ihrer Forschung

Keine versteckten Kosten. Zahlen Sie pro Probe oder wählen Sie ein Abonnement für niedrigere Kosten pro Analyse und bevorzugte Bearbeitung.

Pay-as-you-go Empfohlen

Konfigurieren Sie nur, was Sie brauchen, und genehmigen Sie das Angebot, bevor irgendetwas startet.

Ab €5 / Probe

Preis wird bei der Konfiguration berechnet

Die Kosten hängen vom Pipelinetyp, der Probenzahl, den Referenzdatenbanken und individuellen Klassifikatoren ab. Sie sehen das vollständige Angebot, bevor Sie den Lauf starten.

Konfigurieren und Preis erhalten
Der Preis hängt ab von
Pipelinetyp16S - 18S - ITS
Anzahl der Proben1 - unbegrenzt
ReferenzdatenbankSILVA - UNITE
AnalysetiefeDiversität - Taxonomie - Individuell
Genaues Angebot wird vor Pipelinestart angezeigt. Zahlung erst nach Abschluss.
Oder wählen Sie ein Abonnement — ideal für Teams mit wiederkehrendem Analysevolumen
Labor

Für wachsende Labore mit hohem Durchsatzbedarf und wiederholbaren Workflows.

€499 / Monat
Vertrieb kontaktieren
  • 275 Proben pro Monat
  • 16S-, 18S- und ITS-Pipelines
  • Keine Zusatzkosten für individuelle Klassifikatoren
  • Priorität in der Verarbeitungswarteschlange
  • Publikationsreife Exporte
  • E-Mail- und Bereitschaftssupport
Institution

Für zentrale Einrichtungen und Multi-Team-Umgebungen mit erweiterten Compliance-Anforderungen.

Individuell
Vertrieb kontaktieren
  • Unbegrenzte Proben
  • 16S-, 18S- und ITS-Pipelines
  • Keine Zusatzkosten für individuelle Klassifikatoren
  • Noch höhere Priorität in der Verarbeitungswarteschlange
  • Publikationsreife Exporte
  • E-Mail- und Bereitschaftssupport
  • Dedizierter Support-Ingenieur
Abo-Pläne — Verfügbar ab dem 15. September

Häufige Fragen

Schnelle Antworten zu Dateneigentum, Bearbeitungszeit, unterstützten Formaten und Bereitstellungsoptionen, bevor Sie mit der Analyse beginnen.

Sprechen Sie mit uns
Wem gehören die von mir hochgeladenen Daten?
Sie behalten das vollständige Eigentum an allen hochgeladenen Sequenzierungsdaten, Metadaten und generierten Ergebnissen. Silicobiome verarbeitet die Dateien nur, um die ausgewählten Analysen durchzuführen.
Wie schnell erhalte ich meine Ergebnisse?
Die meisten Standard-16S-, 18S- und ITS-Läufe sind in unter 2 Stunden abgeschlossen; die Bearbeitungszeit hängt von der Probenzahl, der Pipeline-Komplexität und der Verfügbarkeit unserer Infrastruktur ab.
Welche Eingabeformate werden unterstützt?
Silicobiome unterstützt FASTQ, FQ und gzip-komprimierte FASTQ-Archive für Proben. .qza wird für individuelle Klassifikatoren unterstützt.
Kann ich die Analyseparameter anpassen?
Ja. Sie können Adapter, Primer und individuelle Klassifikatoren konfigurieren, bevor Sie einen Lauf starten. Nachgelagerte Analyseoptionen werden für Ihren gewählten Assay optimiert.
Was passiert, wenn eine Pipeline fehlschlägt?
Wenn eine Pipeline Ihre Daten nicht verarbeiten kann, können Sie den Lauf neu konfigurieren oder unser Support-Team um erneute Verarbeitung bitten. Keine Kosten bei fehlgeschlagener Pipeline, Sie zahlen erst, wenn Ergebnisse verfügbar sind.
Kann ich Silicobiome on-premise einsetzen?
Nein. Silicobiome ist eine proprietäre Technologie von STAB VIDA und ausschließlich als Dienstleistung verfügbar.

Bereit, Ihre Mikrobiomforschung zu beschleunigen?

Schließen Sie sich Hunderten von Forschern an, die Silicobiome nutzen, um rohe Sequenzierungsdaten in verwertbare Erkenntnisse zu verwandeln.

Keine Kreditkarte erforderlich Kein Konto erforderlich Zahlung erst bei verfügbaren Ergebnissen